RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	TLE3	Q04726	772 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	CEBPE	Q15744	281 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC18	Q8N456	261 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	WBP1	Q96G27	269 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	DEFB118	Q96PH6	123 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	KLK13	Q9UKR3	277 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC31A1	O15431	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF90	Q03938	601 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895		Q7L0L9	218 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895		B4DEV8	164 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00614	P0C842	121 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PNMT	P11086	282 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R30	P59541	319 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CSNK1G2	P78368	415 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PPC1	479 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		A8MWP6	167 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	DDAH2	O95865	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	BCKDHB	P21953	392 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	BPIFB3	P59826	476 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	FZD5	Q13467	585 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CARD17	Q5XLA6	110 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SHD	Q96IW2	340 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ABLIM3	O94929	683 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ADH1B	P00325	375 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5H8	P0DN80	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	KITLG	P21583	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OTX2	P32243	289 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		C9JQL5	133 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		H0Y8G0	127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	FGF5	P12034	268 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RND3	P61587	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM78B	Q5VT40	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SEC16A	O15027	2179 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	LILRB3	O75022	631 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TK1	P04183	234 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CD5	P06127	495 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR6X1	Q8NH79	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		Q9N2K0	584 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CXCL1	P09341	107 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	THBS4	P35443	961 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GLIPR1	P48060	266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	AMT	P48728	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1CB	P62140	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SGCZ	Q96LD1	299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RTTN	Q86VV8	2226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TIMP1	P01033	207 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TIMP2	P16035	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	BID	P55957	195 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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