RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR2F1	Q13607	317 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PXT1	Q8NFP0	134 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GPR132	Q9UNW8	380 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	BCL2L11	O43521	198 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL13	O43927	109 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	KNG1	P01042	644 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		P04436	131 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CYC1	P08574	325 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A4	P12235	298 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PRF1	P14222	555 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PGAM2	P15259	253 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TCN2	P20062	427 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ACKR3	P25106	362 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CTSS	P25774	331 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	BVES	Q8NE79	360 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DCUN1D4	Q92564	292 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TCEAL3	Q969E4	200 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CHST5	Q9GZS9	411 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		11.46	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0U1RQV5	110 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SGCE	O43556	437 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-G	P17693	338 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	THBS4	P35443	961 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MTCP1	P56278	107 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CARD18	P57730	90 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		Q0VFX4	171 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PECR	Q9BY49	303 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		A8MXK9	166 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	YKT6	O15498	198 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF205	O95201	554 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CER1	O95813	267 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CRH	P06850	196 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FGF2	P09038	288 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PSMB6	P28072	239 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HGFAC	Q04756	655 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF345	Q14585	488 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HAS2	Q92819	552 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		V9GYS6	101 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	LCAT	P04180	440 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HOXA6	P31267	233 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R31	P59538	309 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PP6455	Q8WZ26	134 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RASL12	Q9NYN1	266 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	APOC3	P02656	99 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TDGF1	P13385	188 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RFC3	P40938	356 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RAC3	P60763	192 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TAF9	Q16594	264 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58

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