RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 UBBP0CG47 229 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 VSIG8P0DPA2 414 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB6AP20340 208 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 NR4A2P43354 598 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PYDC2Q56P42 97 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10K2Q6IF99 312 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM108Q6UXF1 575 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 BIVMQ86UB2 503 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4M2Q8NGB6 313 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5D18Q8NGL1 313 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 HPSE2Q8WWQ2 592 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 GHRLQ9UBU3 117 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 SPEF1Q9Y4P9 236 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM14DPA8MWL7 114 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAG2O75638 210 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PTAFRP25105 342 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP15P51511 669 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP1B3P54709 279 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC119Q13432 240 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF181Q2M3W8 571 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ALKBH6Q3KRA9 238 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF718Q3SXZ3 478 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PYHIN1Q6K0P9 492 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QL2Q7Z5L3 287 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ITPKCQ96DU7 683 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD1Q96SE0 405 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB22AQ9UL26 194 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PQLC2LA1A4F0 135 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 KITLGP21583 273 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK2P24941 298 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2W3Q7Z3T1 314 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5A2Q8NGI9 324 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5P3Q8WZ94 311 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ16Q9NPI9 418 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCB10Q9NRK6 738 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 RABL2BQ9UNT1 228 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 GLRXP35754 106 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 BAK1Q16611 211 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC46Q96FV0 321 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ESPL1Q14674 2120 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 NBASA2RRP1 2371 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 DPRXA6NFQ7 191 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 CA6P23280 308 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 GCH1P30793 250 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 FABP6P51161 128 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 IZUMO1Q8IYV9 350 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG5Q9H1Y0 275 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 C14orf119Q9NWQ9 140 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ING4Q9UNL4 249 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 XRCC3O43542 346 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 MNDAP41218 407 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PITPNAQ00169 270 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 SORDQ00796 357 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM69Q5SWH9 247 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ASCL4Q6XD76 172 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 LYSMD2Q8IV50 215 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8H2Q8N162 312 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8N402 240 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNG3Q8TAE7 436 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 NGBQ9NPG2 151 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TPPPO94811 219 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DQB1P01920 261 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 CSF3P09919 207 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM225BP0DP42 221 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF250P15622 560 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PTH2RP49190 550 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 MSMPQ1L6U9 139 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 STEAP3Q658P3 488 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM104Q8NE00 496 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8G5Q8NG78 346 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM46BQ96A09 425 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A13Q99584 98 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 DIABLOQ9NR28 239 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 FZR1Q9UM11 496 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5B21A6NL26 309 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF732B4DXR9 585 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM4BO94953 1096 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 IL7P13232 177 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 GRNP28799 593 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 GPM6AP51674 278 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZK1IP1Q13113 114 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 CALHM1Q8IU99 346 aa21.27■■□□□ 1
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