RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	PSG11	Q9UQ72	335 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	OR5AL1	P0C617	328 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB7A	P51149	207 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	TNXA	Q16473	311 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	FDX2	Q6P4F2	183 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	OR1L1	Q8NH94	360 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SSPN	Q14714	243 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672		Q6ZS52	159 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	GNRHR2	Q96P88	292 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	CMC2	Q9NRP2	79 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	hADV38S2	A0JD32	116 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	ADAM20	O43506	726 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	CIDEA	O60543	219 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	ORM2	P19652	201 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	PSMB6	P28072	239 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SERPINE3	A8MV23	424 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	PPP1CB	P62140	327 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	TRIP11	Q15643	1979 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	NUP205	Q92621	2012 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	METTL12	A8MUP2	240 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	IGHV3-13	P01766	116 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	IGHV3-7	P01780	117 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	CD1B	P29016	333 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC17A1	Q14916	467 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		12.47	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SP1	P08047	785 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	KIR2DS2	P43631	304 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SPINK9	Q5DT21	86 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672		Q6ZSR9	355 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	LINC00052	Q96N35	136 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	HSBP1	O75506	76 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	EXTL1	Q92935	676 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	CBY3	A6NI87	242 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	LRRC29	Q8WV35	223 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		12.46	□□□□□ -0.41
NRXN1-222	ENST00000625672	SEMA7A	O75326	666 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2F1	Q13607	317 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	CD276	Q5ZPR3	534 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2W5	A6NFC9	320 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	GPANK1	O95872	356 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	NAAA	Q02083	359 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	PDCD1	Q15116	288 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	COX6B1	P14854	86 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672		Q3ZCU0	254 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	RFESD	Q8TAC1	157 aa		12.46	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	SPINK4	O60575	86 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	HTR1D	P28221	377 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	SOX8	P57073	446 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	FBXL6	Q8N531	539 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	RNF2	Q99496	336 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2T8	A6NH00	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	MGP	P08493	103 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	ACP1	P24666	158 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	THBS4	P35443	961 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2B8P	P59922	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	POMT2	Q9UKY4	750 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	RABAC1	Q9UI14	185 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	TMPRSS11D	O60235	418 aa		12.45	□□□□□ -0.42
NRXN1-222	ENST00000625672	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42

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