RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-215	ENST00000622972	RAB40B	Q12829	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ATR	Q13535	2644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GALE	Q14376	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR8B8	Q15620	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SNCB	Q16143	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		Q6ZSR3	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		R4GMQ9	66 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		A6NIN4	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		H3BSA7	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	MPZL2	O60487	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	FCN3	O75636	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CCL1	P22362	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GATA3	P23771	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	DCTD	P32321	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SLC6A9	P48067	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TPTE	P56180	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	HILS1	P60008	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ECH1	Q13011	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	INSL4	Q14641	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RFK	Q969G6	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	COG8	Q96MW5	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GPR84	Q9NQS5	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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