RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600628.2

SSBP4-208, Transcript of single stranded DNA binding protein 4, human

TSL 3

Gene SSBP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSBP4-208	ENST00000600628	C22orf46	C9J442	243 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	CDIPT	O14735	213 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	KRT8	P05787	483 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	FAH	P16930	419 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ADRA2C	P18825	462 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PEX2	P28328	305 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	NPY4R	P50391	375 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	OR12D2	P58182	307 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ERVK11-1	P61568	191 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	GNG3	P63215	75 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ACTC1	P68032	377 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ACTA1	P68133	377 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	RAB40B	Q12829	278 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	GALE	Q14376	348 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	RCN1	Q15293	331 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ESCO2	Q56NI9	601 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	WDR38	Q5JTN6	314 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	STUM	Q69YW2	141 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	USP43	Q70EL4	1123 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	DOK3	Q7L591	496 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PHC2	Q8IXK0	858 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	SYS1	Q8N2H4	156 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	AQP3	Q92482	292 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	UPRT	Q96BW1	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	C10orf35	Q96D05	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	RNFT2	Q96EX2	444 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PELI1	Q96FA3	418 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628		Q96MT0	163 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	MICU1	Q9BPX6	476 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	HES4	Q9HCC6	221 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ZNF222	Q9UK12	451 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628		H0YAE9	185 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	P2RY10	O00398	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	TCF21	O43680	179 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	NRAS	P01111	189 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	GRP	P07492	148 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	LIMS3	P0CW19	117 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	LIMS4	P0CW20	117 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PGA5	P0DJD9	388 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	IRF2	P14316	349 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	MMP9	P14780	707 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	GNAL	P38405	381 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PITPNB	P48739	271 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	IL18R1	Q13478	541 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	KCNJ8	Q15842	424 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	OR8S1	Q8NH09	359 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	LRRC29	Q8WV35	223 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PIGC	Q92535	297 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	STMN2	Q93045	179 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	SEH1L	Q96EE3	360 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	RNF170	Q96K19	258 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	TECTB	Q96PL2	329 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	TBX5	Q99593	518 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	CHST5	Q9GZS9	411 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SSBP4-208	ENST00000600628	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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