RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OPN4Q9UHM6 478 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LRP12Q9Y561 859 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC182A6NF36 153 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OOEPA6NGQ2 149 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZAR1LA6NP61 321 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 A8MXK9 166 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM77I1YAP6 450 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 M0R129 80 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A1O15245 554 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM20O43506 726 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA2O43678 99 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 VENTXO95231 258 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FSTL3O95633 263 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GYPAP02724 150 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 EPHA2P29317 976 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1E1P36543 226 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GMFBP60983 142 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 POU4F2Q12837 409 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PRDX4Q13162 271 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM16LQ309B1 348 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 XAF1Q6GPH4 301 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM163Q8TC26 289 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC29Q8WV35 223 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf50Q8WW18 174 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RNF170Q96K19 258 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A7Q99884 636 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HMG20AQ9NP66 347 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NUP50Q9UKX7 468 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ACOD1A6NK06 481 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CDIPTO14735 213 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PHYHO14832 338 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS2O15393 492 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF254O75437 659 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MAP2K3P46734 347 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NPY4RP50391 375 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CXCR4P61073 352 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ACTG1P63261 375 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CSNK2BP67870 215 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PAX8Q06710 450 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MICBQ29980 383 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TTC23Q5W5X9 447 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CD276Q5ZPR3 534 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf73Q69YU5 71 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MOB3CQ70IA8 216 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GID4Q8IVV7 300 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CYGBQ8WWM9 190 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MUL1Q969V5 352 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LYZL4Q96KX0 146 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR8B4Q96RC9 309 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MNTQ99583 582 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TBX5Q99593 518 aa6.94□□□□□ -1.3
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