RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 COL4A5P29400 1685 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PQD3 144 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 SSTP61278 116 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FUT5Q11128 374 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 OR2C3Q8N628 320 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 Q5BKY6 102 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 FAM210BQ96KR6 192 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GTQ1 180 aa9.24□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR2J2O76002 312 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 NXPH3O95157 252 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.24□□□□□ -0.93
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