RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575322.1

AKAP1-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene AKAP1, Length 650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-216ENST00000575322 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
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AKAP1-216ENST00000575322 MED28Q9H204 178 aa5.89□□□□□ -1.47
AKAP1-216ENST00000575322 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
AKAP1-216ENST00000575322 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.89□□□□□ -1.47
AKAP1-216ENST00000575322 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
AKAP1-216ENST00000575322 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.89□□□□□ -1.47
AKAP1-216ENST00000575322 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.89□□□□□ -1.47
AKAP1-216ENST00000575322 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
AKAP1-216ENST00000575322 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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