RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 USP43Q70EL4 1123 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 DUX4Q9UBX2 424 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 METTL15A6NJ78 407 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 P2RY10O00398 339 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 SULT1C4O75897 302 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 GABRB1P18505 474 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 CCL1P22362 96 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 MTNR1AP48039 350 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 GNG3P63215 75 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 OCLNQ16625 522 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 WDR38Q5JTN6 314 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 TMEM42Q69YG0 159 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 STUMQ69YW2 141 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 RORBQ92753 470 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 UPRTQ96BW1 309 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 OR51I2Q9H344 312 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 AASSQ9UDR5 926 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 NUP50Q9UKX7 468 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 OR5B21A6NL26 309 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ZNF732B4DXR9 585 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 DVL1O14640 695 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 RHBDL1O75783 438 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 AMY2BP19961 511 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ATP6V1E1P36543 226 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 MICBQ29980 383 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 MOB3CQ70IA8 216 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 FGFRL1Q8N441 504 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 RNFT2Q96EX2 444 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 ZNF69Q9UC07 566 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-219ENST00000550655 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 TMPRSS2O15393 492 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 AKR7A2O43488 359 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 TP53I3Q53FA7 332 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 DOK3Q7L591 496 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 CCL13Q99616 98 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ESM1Q9NQ30 184 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 PLATP00750 562 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 NRASP01111 189 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 KIR3DL2P43630 455 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 GMFBP60983 142 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 FGF12P61328 243 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ACTC1P68032 377 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ACTA1P68133 377 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ZNF91Q05481 1191 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ZSCAN26Q16670 478 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ODF4Q2M2E3 257 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 CDONQ4KMG0 1287 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 CD276Q5ZPR3 534 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 AQP3Q92482 292 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 GPR173Q9NS66 373 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 GNG8Q9UK08 70 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 A6NIN4 97 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 DLGAP1O14490 977 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 BAG2O95816 211 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 TFF1P04155 84 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-219ENST00000550655 SELLP14151 372 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms