RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PIGPP57054 158 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 PRDX4Q13162 271 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 MPV17LQ2QL34 196 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf17Q53FE4 359 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 SEC22AQ96IW7 307 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 GSX2Q9BZM3 304 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 LIPT2A6NK58 231 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 POM121Q96HA1 1249 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SRRQ9GZT4 340 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OOEPA6NGQ2 149 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 SFT2D2O95562 160 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 OGG1O15527 345 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM235A6NFC5 223 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 WDR1O75083 606 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 NGFP01138 241 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 ADIRFQ15847 76 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF787Q6DD87 383 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 BAP18Q8IXM2 172 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.58□□□□□ -1.2
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