RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM122BQ7Z309 247 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT20Q8IY31 132 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MICU1Q9BPX6 476 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RETNQ9HD89 108 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA1456Q9P272 454 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF222Q9UK12 451 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBDO15205 165 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTP4A3O75365 173 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAP30O75446 220 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRS3P32247 399 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR4P46093 362 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DLX6P56179 175 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX3Q13277 289 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL18R1Q13478 541 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DS1Q14954 304 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCN8Q6JVE9 175 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC80Q76M96 950 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD177Q8N6Q3 437 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDSLQ96GA7 329 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPCSQ9HAB8 311 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHCGQ9UBD6 479 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.97□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC1A7O00341 560 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC42EP2O14613 210 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR1DP28221 377 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDOSTP39656 456 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INSL3P51460 131 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM3AP98173 230 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAGHQ16775 308 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIGD6Q17RP2 521 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBLL1Q75N03 491 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR11H1Q8NG94 326 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF170Q96K19 258 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52B2Q96RD2 323 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAO1Q9UJM8 370 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B9D1Q9UPM9 204 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.96□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKHD1P08F94 4074 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01548A6NM66 108 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF728P0DKX0 622 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNTFRP26992 372 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRABP1P29762 137 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDX2P32119 198 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYBA2P53672 197 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTPNP58546 118 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKCDQ05655 676 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFYCQ13952 458 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT72Q14CN4 511 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF13Q15543 124 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBED5Q49AG3 693 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX38Q6PEX7 206 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRAM2Q6UX65 266 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF429Q86V71 674 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BATF2Q8N1L9 274 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COMMD1Q8N668 190 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LZICQ8WZA0 190 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REEP6Q96HR9 211 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COPS4Q9BT78 406 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPMQ9NSP4 180 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0QZK8 103 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XRCC2O43543 280 aa7.94□□□□□ -1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms