RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ERICH4A6NGS2 130 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C9JVG2 144 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM178BH3BS89 294 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PHYHO14832 338 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ARPC3O15145 178 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SGCEO43556 437 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 GMDSO60547 372 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DCTN3O75935 186 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RENP00797 406 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-HP01893 362 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CD14P08571 375 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ADRA2AP08913 450 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IGFBP5P24593 272 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HTR2AP28223 471 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RRM2P31350 389 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 UGT2B15P54855 530 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PRKCDQ05655 676 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 BNIP2Q12982 314 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MAPK11Q15759 364 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP7Q16829 419 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TTMPQ5BVD1 217 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CARM1Q86X55 608 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MICU2Q8IYU8 434 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR10A6Q8NH74 314 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PTP4A1Q93096 173 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MCHR2Q969V1 340 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C4orf45Q96LM5 186 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 COQ7Q99807 217 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SMR3AQ99954 134 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SH3GL3Q99963 347 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 GAL3ST1Q99999 423 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RGCCQ9H4X1 137 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 YY1AP1Q9H869 796 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MDFICQ9P1T7 246 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PRV1 198 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS37A4D1T9 235 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf49A4QMS7 147 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf98E9PRG8 122 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CXCR6O00574 342 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 XRCC2O43543 280 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RP2O75695 350 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TXNDC12O95881 172 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IFNGP01579 166 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV2-5P01817 119 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS2P07478 247 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PRG2P13727 222 aa3.51□□□□□ -1.85
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