RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 SELEP16581 610 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CCNOP22674 350 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ACKR3P25106 362 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 GDNFP39905 211 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 RAD52P43351 418 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 RFX2P48378 723 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 RAG2P55895 527 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 MTCP1P56278 107 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ACTBP60709 375 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 BTG1P62324 171 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ACTG1P63261 375 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 PMPCAQ10713 525 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 KLRB1Q12918 225 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 FOXF2Q12947 444 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 UBE2V2Q15819 145 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00303Q3SY05 128 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 PLET1Q6UQ28 207 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 GFRALQ6UXV0 394 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ASCL4Q6XD76 172 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 PXT1Q8NFP0 134 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 BORCS8Q96FH0 119 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 SOX7Q9BT81 388 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 OR10A4Q9H209 315 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CDH20Q9HBT6 801 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 IL36GQ9NZH8 169 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 C5orf63A6NC05 138 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 OR5H1A6NKK0 313 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 RAB27BO00194 218 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 AKR7A2O43488 359 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CA11O75493 328 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 RAD51DO75771 328 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 LYZL6O75951 148 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 TOXO94900 526 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 KDM4BO94953 1096 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 LPLP06858 475 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CSF1P09603 554 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CD3GP09693 182 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 GLI4P10075 376 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 RAC2P15153 192 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 SLC6A1P30531 599 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 EFNB2P52799 333 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 DGCR2P98153 550 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 TNK1Q13470 666 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 PPA1Q15181 289 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 WDR31Q8NA23 367 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 OR52I2Q8NH67 350 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 GPX8Q8TED1 209 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 TM2D1Q9BX74 207 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC31A-241ENST00000515749 METTL9Q9H1A3 318 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms