RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	C4orf45	Q96LM5	186 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	SLITRK2	Q9H156	845 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	POLE4	Q9NR33	117 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GUS0	222 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GWJ7	208 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	OR6C6	A6NF89	314 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC22A2	O15244	555 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	BDKRB2	P30411	391 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	BPIFB3	P59826	476 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	SELENOW	P63302	87 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PRKCD	Q05655	676 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PAX8	Q06710	450 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ZMYND11	Q15326	602 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	MED22	Q15528	200 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	SGCA	Q16586	387 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	CDON	Q4KMG0	1287 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF774	Q6NX45	483 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ADCK1	Q86TW2	530 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	LZIC	Q8WZA0	190 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	UPRT	Q96BW1	309 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	HAVCR1	Q96D42	359 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	WDFY2	Q96P53	400 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	KRT84	Q9NSB2	600 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC30	A6NM36	301 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM178B	H3BS89	294 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	FBP2	O00757	339 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	XKRY	O14609	159 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	SGCE	O43556	437 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	DOK2	O60496	412 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	NGF	P01138	241 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	IFNW1	P05000	195 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	IFI30	P13284	250 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	KDELR2	P33947	212 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	HTR5A	P47898	357 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PAX2	Q02962	417 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAM2	Q15035	370 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TTMP	Q5BVD1	217 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZR03	302 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	OAF	Q86UD1	273 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PARP8	Q8N3A8	854 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM86B	Q8N661	226 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2T12	Q8NG77	320 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	NSMAF	Q92636	917 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	RASD2	Q96D21	266 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF583	Q96ND8	569 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2V2	Q96R30	315 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	GID8	Q9NWU2	228 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	MIOX	Q9UGB7	285 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A0G2JND7	137 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GUV1	79 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	PRSS37	A4D1T9	235 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PDE4D-222	ENST00000514552	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		5.6	□□□□□ -1.51

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