RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.33□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 TP53I3Q53FA7 332 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 WDR38Q5JTN6 314 aa7.33□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 TTC23Q5W5X9 447 aa7.33□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 GNG8Q9UK08 70 aa7.32□□□□□ -1.24
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