RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491958.5

SELENOM-208, Transcript of selenoprotein M, human

TSL 2

Gene SELENOM, Length 605 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENOM-208	ENST00000491958	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958		A0A0U1RQV5	110 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	FKBP6	O75344	327 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	RHBDL1	O75783	438 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	DLX1	P56177	255 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	CBX1	P83916	185 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	APOF	Q13790	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	PSMD9	O00233	223 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	SIGLEC5	O15389	551 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	GPM6A	P51674	278 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	ROM1	Q03395	351 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	KLRD1	Q13241	179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	FLOT2	Q14254	428 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	TAF9	Q16594	264 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	OCLN	Q16625	522 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	TEAD3	Q99594	435 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	FBP1	P09467	338 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	MAP2K3	P46734	347 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	CAV3	P56539	151 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	MED30	Q96HR3	178 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	POMP	Q9Y244	141 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENOM-208	ENST00000491958	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	NPFF	O15130	113 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	CLPX	O76031	633 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	GLRA1	P23415	457 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	CRISP1	P54107	249 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	PROK1	P58294	105 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	GNG3	P63215	75 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	PNKD	Q8N490	385 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958		M0R1W7	72 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	GYG2	O15488	501 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	PRKY	O43930	277 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	ZNF254	O75437	659 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SELENOM-208	ENST00000491958	PSG2	P11465	335 aa		13.38	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms