RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 A4D1N5 150 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 A8MVM7 634 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 C9orf172C9J069 976 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CYR61O00622 381 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SLC17A2O00624 439 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PTGESO14684 152 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 FCMRO60667 390 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 OR2J2O76002 312 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 KAT7O95251 611 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CLDN7O95471 211 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 NTN1O95631 604 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 IGLV3-27P01718 113 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CATP04040 527 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 THY1P04216 161 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 IFNA6P05013 189 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CSN2P05814 226 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM225BP0DP42 221 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 AKR1A1P14550 325 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 MAKP20794 623 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 DTYMKP23919 212 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SLC6A6P31641 620 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SOX2P48431 317 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SGSHP51688 502 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SLC25A1P53007 311 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM33P57088 247 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 BTG2P78543 158 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 HLA-DRB3P79483 266 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 HSF1Q00613 529 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PSG6Q00889 435 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 COL10A1Q03692 680 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 TGM3Q08188 693 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PRDX4Q13162 271 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 IL15RAQ13261 267 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 FAM189A2Q15884 450 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 BATFQ16520 125 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM64Q6YI46 380 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 GRINAQ7Z429 371 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 LINC01551Q86U37 167 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF595Q8IYB9 648 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 COX18Q8N8Q8 333 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 HAS2Q92819 552 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 KLK6Q92876 244 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 TSLPQ969D9 159 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 FOXB1Q99853 325 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SPATC1LQ9H0A9 340 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 RAB22AQ9UL26 194 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 YIPF1Q9Y548 306 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 RLFQ13129 1914 aa3.25□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PLXNB2O15031 1838 aa3.24□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.24□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 A0A1W2PS29 197 aa3.24□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.24□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa3.24□□□□□ -1.89
FUBP1-211ENST00000489495 H0YL77 283 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms