RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZNF461Q8TAF7 563 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ENKURQ8TC29 256 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GALNT14Q96FL9 552 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SNF8Q96H20 258 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RDH12Q96NR8 316 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ABCB9Q9NP78 766 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SNX24Q9Y343 169 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ATRXP46100 2492 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TEX14Q8IWB6 1497 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0556O60303 1618 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PRG6 482 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA8KD6RF30 607 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF11BO00300 401 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TCAPO15273 167 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ADAP1O75689 374 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SUPT7LO94864 414 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 DEXIO95424 95 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ATP6V1G2O95670 118 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 FUT3P21217 361 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MYCNOSP40205 109 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HERVK_113P61574 105 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GNB2P62879 340 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CACNG7P62955 275 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SLC7A9P82251 487 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MED21Q13503 144 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HERPUD1Q15011 391 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB6Q15916 424 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CASC10Q5T4H9 136 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SDHAF4Q5VUM1 108 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 EPGNQ6UW88 154 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 Q6ZVH6 145 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OR51Q1Q8NH59 317 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OR1S1Q8NH92 325 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NT5CQ8TCD5 201 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RXFP2Q8WXD0 754 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SEH1LQ96EE3 360 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OR2M4Q96R27 311 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PRORYQ9H606 182 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ASB8Q9H765 288 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TREX1Q9NSU2 369 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 DEC1Q9P2X7 70 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ABCC8Q09428 1581 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RLFQ13129 1914 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TMEM210A6NLX4 147 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GJE1A6NN92 205 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 UBDO15205 165 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 FABP7O15540 132 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HLA-DRAP01903 254 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CD3GP09693 182 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TDGF1P13385 188 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HTR1DP28221 377 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HSPA13P48723 471 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CAV2P51636 162 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TDGF1P3P51864 188 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CDKN2DP55273 166 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RAB38P57729 211 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MADCAM1Q13477 382 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 KIR2DS1Q14954 304 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PON2Q15165 354 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms