RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 CDH24Q86UP0 819 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 GPX8Q8TED1 209 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 UPRTQ96BW1 309 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 STARD4Q96DR4 205 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF75AQ96N20 296 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A13Q99584 98 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 CST11Q9H112 138 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 CDH20Q9HBT6 801 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 KLK11Q9UBX7 282 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 ING4Q9UNL4 249 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.97□□□□□ -0.97
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 J3QW42 95 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CBR1P16152 277 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 GIFP27352 417 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TIMP3P35625 211 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 WNT5AP41221 380 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 FUT6P51993 359 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP1B3P54709 279 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 PRSS12P56730 875 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 ZP1P60852 638 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 BTG1P62324 171 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 GUCA2AQ02747 115 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 MOB3CQ70IA8 216 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 AKAP14Q86UN6 197 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 FTMTQ8N4E7 242 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8NA96 180 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CHST4Q8NCG5 386 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM104Q8NE00 496 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 AQP3Q92482 292 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 PIGCQ92535 297 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 BORCS8Q96FH0 119 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 STARD10Q9Y365 291 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 MED12LQ86YW9 2145 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0B4J293 547 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM235A6NFC5 223 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 ICMTO60725 284 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TOXO94900 526 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CST4P01036 141 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 NGFP01138 241 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 IL2RAP01589 272 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TCRBP04435 133 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 MELTFP08582 738 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM225BP0DP42 221 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 VEGFCP49767 419 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 RBP2P50120 134 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TDGF1P3P51864 188 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TSC22D1Q15714 1073 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CARTPTQ16568 116 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 TATDN3Q17R31 274 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZTK2 550 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 BEND4Q6ZU67 534 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 BTN2A1Q7KYR7 527 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.95□□□□□ -0.98
GTPBP1-211ENST00000487538 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms