RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	MPZL2	O60487	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	FAM20B	O75063	409 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	DHRS3	O75911	302 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ISG15	P05161	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SELL	P14151	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ANPEP	P15144	967 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	GATA3	P23771	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	MPZ	P25189	248 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	CCR9	P51686	369 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	CSNK2B	P67870	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	PAX8	Q06710	450 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF154	Q13106	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SNCB	Q16143	134 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SGCD	Q92629	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792		R4GMQ9	66 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	C22orf46	C9J442	243 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792		E9PI62	339 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792		H0YJX3	145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	NDUFA2	O43678	99 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	LALBA	P00709	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	GNAO1	P09471	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF12	P17014	697 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	HSD11B1	P28845	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	TGM4	P49221	684 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	DLX1	P56177	255 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	RAB40B	Q12829	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	TAF13	Q15543	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	OR8G1	Q15617	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	CARTPT	Q16568	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CUX1-208	ENST00000485792	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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