RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 RPP14O95059 124 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SERPINA3P01011 423 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 CCR9P51686 369 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ISL1P61371 349 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RCN1Q15293 331 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TMEM42Q69YG0 159 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 FDX2Q6P4F2 183 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SSX6Q7RTT6 188 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 ZNF573Q86YE8 665 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SYS1Q8N2H4 156 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 LRRC29Q8WV35 223 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RORBQ92753 470 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 RASL12Q9NYN1 266 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 INSIG2Q9Y5U4 225 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 AUP1Q9Y679 476 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-211ENST00000476336 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.15□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 C3orf80F5H4A9 247 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 SYT7O43581 403 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ZNF205O95201 554 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ISG15P05161 165 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 FPR2P25090 351 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 GPM6AP51674 278 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ZNF85Q03923 595 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 GALEQ14376 348 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 FAM201AQ5SY85 155 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 DEFB108BQ8NET1 73 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 OR14K1Q8NGZ2 314 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 PP6455Q8WZ26 134 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GTI1 187 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ZNF732B4DXR9 585 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 H0YAE9 185 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ADAM20O43506 726 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 TCF21O43680 179 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 APOL3O95236 402 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 IGHA1P01876 353 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 FAHP16930 419 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ADRA2CP18825 462 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ZNF91Q05481 1191 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 MED21Q13503 144 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 USP43Q70EL4 1123 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 MOB3CQ70IA8 216 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 WDR86Q86TI4 376 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 LGALS12Q96DT0 336 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 MED30Q96HR3 178 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 JMJD8Q96S16 334 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 JAM3Q9BX67 310 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 OR51I2Q9H344 312 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 SLC7A11Q9UPY5 501 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 P2RY10O00398 339 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 TMPRSS2O15393 492 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 HTR1AP08908 422 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 DCKP27707 260 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 CD80P33681 288 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 BPIFB3P59826 476 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 CSNK2BP67870 215 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 PAX2Q02962 417 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 PAX8Q06710 450 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms