RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 PFDN5Q99471 154 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF649Q9BS31 505 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 DUSP13Q9UII6 198 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 HIVEP2P31629 2446 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SERTM1A2A2V5 107 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 C7orf66A4D0T2 115 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 WRBO00258 174 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 KCNAB3O43448 404 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 AKR7A3O95154 331 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZFPL1O95159 310 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 IL18BPO95998 194 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 APOC1P02654 83 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 GAAP10253 952 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 NID1P14543 1247 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CPN1P15169 458 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF17P17021 662 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SPI1P17947 270 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 BDH1Q02338 343 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PPA1Q15181 289 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TSC22D1Q15714 1073 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 AWAT2Q6E213 333 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF529Q6P280 563 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FAM122BQ7Z309 247 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 KDM8Q8N371 416 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 STPG2Q8N412 459 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PERPQ96FX8 193 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD19PQ9H560 264 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 JMJD1CQ15652 2540 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FAM74A7A6NL05 159 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PMP2P02689 132 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR4E1P0C645 316 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CAMLGP49069 296 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR2B8PP59922 312 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PXKQ7Z7A4 578 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 BVESQ8NE79 360 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ST7LQ8TDW4 575 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1W2PNV4 684 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OIP5O43482 229 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GPANK1O95872 356 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 NMBP08949 121 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CD80P33681 288 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 APLNRP35414 380 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 C21orf58P58505 322 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RAB2AP61019 212 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF85Q03923 595 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF273Q14593 569 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SHISA5Q8N114 240 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GABRG1Q8N1C3 465 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TOMM40LQ969M1 308 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CRLF2Q9HC73 371 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.27□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MTORP42345 2549 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms