RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LGALS8	O00214	317 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	PCMT1	P22061	227 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	AQP4	P55087	323 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GNG3	P63215	75 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ8	Q15842	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF404	Q494X3	552 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ESCO2	Q56NI9	601 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	SYS1	Q8N2H4	156 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	MIOX	Q9UGB7	285 aa		14.87	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OOEP	A6NGQ2	149 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR5B21	A6NL26	309 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FOXH1	O75593	365 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF12	P17014	697 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	MYL12A	P19105	171 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CCL1	P22362	96 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	DCK	P27707	260 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	WDR82	Q6UXN9	313 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TFAP2C	Q92754	450 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TMEM160	Q9NX00	188 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		14.86	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GYPA	P02724	150 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	WNT2	P09544	360 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LIMS3	P0CW19	117 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LIMS4	P0CW20	117 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	EGR1	P18146	543 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ETV1	P50549	477 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GNB2	P62879	340 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	MED21	Q13503	144 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FDX2	Q6P4F2	183 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TMEM80	Q96HE8	168 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR8B2	Q96RD0	313 aa		14.85	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902		A0A0G2JMP0	313 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902		A0A0X1KG70	313 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ADAM20	O43506	726 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	XPNPEP2	O43895	674 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FSTL3	O95633	263 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA3	P01011	423 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LHB	P01229	141 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF20	P17024	532 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CCR9	P51686	369 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	MICB	Q29980	383 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	KRT74	Q7RTS7	529 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GGH	Q92820	318 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF649	Q9BS31	505 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR51I2	Q9H344	312 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	HHLA2	Q9UM44	414 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902		E9PI62	339 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902		H0YJX3	145 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	AKR7A2	O43488	359 aa		14.83	□□□□□ -0.04

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