RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 TIGD4Q8IY51 512 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 B9D2Q9BPU9 175 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR10A2Q9H208 303 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 YY1AP1Q9H869 796 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 NDUFAF4Q9P032 175 aa11.51□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 TMEM210A6NLX4 147 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 EDF1O60869 148 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 NCK1P16333 377 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 FMO3P31513 532 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ENTPD1P49961 510 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 RPL31P62899 125 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 BLCAPP62952 87 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 MXRA7P84157 204 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 SPIBQ01892 262 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 PRDX4Q13162 271 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 SSX2Q16385 188 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 PIGCQ92535 297 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 RCN3Q96D15 328 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 PGAM5Q96HS1 289 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.5□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 MEGF11A6BM72 1044 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 A6NDX4 124 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 H3BUI4 141 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 F2RL2O00254 374 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 APOC1P02654 83 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ARG1P05089 322 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 PSG2P11465 335 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 PSKH1P11801 424 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 IFNGR2P38484 337 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 SMIM11AP58511 58 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ERVFRD-1P60508 538 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 CD83Q01151 205 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 Q6ZS46 218 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 FAM86B1Q8N7N1 296 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR2T27Q8NH04 317 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 CHID1Q9BWS9 393 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 C1orf21Q9H246 121 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 MUC13Q9H3R2 512 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 SAR1AQ9NR31 198 aa11.49□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 DHRS12A0PJE2 317 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 VGLL3A8MV65 326 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 SYNGR1O43759 233 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 RHBDL1O75783 438 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 GADD45GO95257 159 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 GPM6AP51674 278 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 SLC25A1P53007 311 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 RNF144BQ7Z419 303 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 LINC00471Q8N535 108 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR6K6Q8NGW6 343 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ABCB9Q9NP78 766 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 USE1Q9NZ43 259 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 V9GYQ6 96 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 COL7A1Q02388 2944 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.48□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 GMNNO75496 209 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 GYPBP06028 91 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 CCL3L1P16619 93 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 OR12D2P58182 307 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 KLHL12Q53G59 568 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 MALSU1Q96EH3 234 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 U3KQK5 164 aa11.47□□□□□ -0.57
CENPF-202ENST00000464322 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms