RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP2K3P46734 347 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MTNR1AP48039 350 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 GPM6AP51674 278 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 DLX1P56177 255 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC42P60953 191 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 GMFBP60983 142 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 EGR3Q06889 387 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC29Q8WV35 223 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MNTQ99583 582 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL13Q99616 98 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 RGCCQ9H4X1 137 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SP140LQ9H930 580 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MIOXQ9UGB7 285 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 COL6A5A8TX70 2615 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 J3QLW9 94 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 PHYHO14832 338 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF2P14316 349 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF19P17023 458 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL1P22362 96 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 RCN1Q15293 331 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2V2Q15819 145 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN26Q16670 478 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDONQ4KMG0 1287 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF691Q5VV52 312 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-206ENST00000461017 PELI1Q96FA3 418 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8B2Q96RD0 313 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MICU1Q9BPX6 476 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ESM1Q9NQ30 184 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF69Q9UC07 566 aa5.81□□□□□ -1.48
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