RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 PLXNB1O43157 2135 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PRQ8 180 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MEGF11A6BM72 1044 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 F5H5K5 113 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 J3KTA2 159 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 RGS10O43665 173 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DIRAS1O95057 198 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 LCATP04180 440 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 AMY2BP19961 511 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SAA4P35542 130 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 GGT2P36268 569 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 GPR4P46093 362 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 HMGA2P52926 109 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 TPTEP56180 551 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 FXYD6P3P58550 94 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 CDC42P60953 191 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF92Q03936 586 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MZT1Q08AG7 82 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DGCR6Q14129 220 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 GPR107Q5VW38 600 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SPARTQ8N0X7 666 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 OR6V1Q8N148 313 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 FGFRL1Q8N441 504 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DTX3Q8N9I9 347 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ST8SIA4Q92187 359 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MYDGFQ969H8 173 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 TSSK2Q96PF2 358 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 RERGLQ9H628 205 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 VNN3Q9NY84 501 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 RHCGQ9UBD6 479 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 B9D1Q9UPM9 204 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1B0GW55 424 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MEIOCA2RUB1 952 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 M0R1W7 72 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 ARPC3O15145 178 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 PAHP00439 452 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 IFNGR2P38484 337 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DDOSTP39656 456 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 OMPP47874 163 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SERPINB10P48595 397 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 POU4F2Q12837 409 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 PCK2Q16822 640 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MICBQ29980 383 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 WDR38Q5JTN6 314 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 Q8N2B8 174 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SGCDQ92629 289 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 MUL1Q969V5 352 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 SPSB4Q96A44 273 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 PHF21AQ96BD5 680 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 Q96MT0 163 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 CCL13Q99616 98 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00578-201ENST00000439009 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms