RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 SPINK14Q6IE38 97 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR13D1Q8NGV5 346 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MCHR2Q969V1 340 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OCEL1Q9H607 264 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR2A2Q6IF42 318 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR10D3Q8NH80 312 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GPBAR1Q8TDU6 330 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CCL17Q92583 94 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CLDN23Q96B33 292 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GALNSP34059 522 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ALG14Q96F25 216 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ADGRG7Q96K78 797 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF32P17041 273 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 KIAA0040Q15053 153 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CBLN3Q6UW01 205 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR5H15A6NDH6 313 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CEACAM6P40199 344 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 RAB35Q15286 201 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FAM122AQ96E09 287 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CYTIPO60759 359 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 EPPINO95925 133 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FUT3P21217 361 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TJP1Q07157 1748 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 KISS1Q15726 138 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 BAP18Q8IXM2 172 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PP6455Q8WZ26 134 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 NDFIP1Q9BT67 221 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SERPINE3A8MV23 424 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CD37P11049 281 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MICBQ29980 383 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SPINK9Q5DT21 86 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MRGPREQ86SM8 312 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 DOK1Q99704 481 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 NGFP01138 241 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 RBP4P02753 201 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IL5P05113 134 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ADRB1P08588 477 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ST8SIA2Q92186 375 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR51I2Q9H344 312 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GLI3P10071 1580 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TNFRSF1AP19438 455 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 AKR1C3P42330 323 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CDK5Q00535 292 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 HES3Q5TGS1 186 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GNG3P63215 75 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM229BQ8NBD8 167 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GPR31O00270 319 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 C3AR1Q16581 482 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OCIAD1Q9NX40 245 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 NXPH1P58417 271 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 C3orf80F5H4A9 247 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR2J3O76001 311 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MMP15P51511 669 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms