RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMD9	O00233	223 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR37	O15354	613 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF254	O75437	659 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1B1	P15313	513 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	EPHA2	P29317	976 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CDON	Q4KMG0	1287 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF170	Q96K19	258 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZAR1L	A6NP61	321 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	AKR7A2	O43488	359 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KNG1	P01042	644 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV1-69	P01742	117 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP2K3	P46734	347 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM86B	Q8N661	226 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LHX4	Q969G2	390 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFB3	O43676	98 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MELTF	P08582	738 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SELL	P14151	372 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GPM6A	P51674	278 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf73	Q69YU5	71 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GAFA1	Q96PS6	74 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51I2	Q9H344	312 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	BEX1	Q9HBH7	125 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR84	Q9NQS5	396 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT84	Q9NSB2	600 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		14.59	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GVI7	797 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		G3V2T6	193 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R129	80 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RHBDL1	O75783	438 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GNG3	P63215	75 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	IKZF1	Q13422	519 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP78	Q5JTW2	689 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4F5	Q8NH21	305 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM163	Q8TC26	289 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	MNT	Q99583	582 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CHIA	Q9BZP6	476 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	NLK	Q9UBE8	527 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		14.58	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5B21	A6NL26	309 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF732	B4DXR9	585 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SIGLEC5	O15389	551 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS3	O75911	302 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	TTR	P02766	147 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYBA1	P05813	215 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	FAS	P25445	335 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RASSF2	P50749	326 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	GMFB	P60983	142 aa		14.57	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCR4	P61073	352 aa		14.57	□□□□□ -0.08

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