RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 ASCL4Q6XD76 172 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-204ENST00000425660 C3P1Q6ZMU1 363 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-204ENST00000425660 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.1□□□□□ -0.31
ACTB-204ENST00000425660 ACBD4Q8NC06 268 aa13.1□□□□□ -0.31
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ACTB-204ENST00000425660 MARVELD1Q9BSK0 173 aa13.1□□□□□ -0.31
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ACTB-204ENST00000425660 ZNF35P13682 527 aa13.08□□□□□ -0.32
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ACTB-204ENST00000425660 A8MXE2 369 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
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ACTB-204ENST00000425660 OR56B1Q8NGI3 324 aa13.07□□□□□ -0.32
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ACTB-204ENST00000425660 TMEM50BP56557 158 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 PRDX4Q13162 271 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 PCGF3Q3KNV8 242 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 AGAP6Q5VW22 663 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 CMBLQ96DG6 245 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-204ENST00000425660 DPAGT1Q9H3H5 408 aa13.06□□□□□ -0.32
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