RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 F10P00742 488 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NAT2P11245 290 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 COX6B1P14854 86 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF32P17041 273 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PRKACBP22694 351 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NTF4P34130 210 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CBX5P45973 191 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ARG2P78540 354 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 UNC119Q13432 240 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PPA1Q15181 289 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CDNFQ49AH0 187 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF766Q5HY98 468 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZTK2 550 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC107Q8WV48 283 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SGK3Q96BR1 496 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 LYZL4Q96KX0 146 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 LURAP1Q96LR2 239 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GPER1Q99527 375 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR10A4Q9H209 315 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF224Q9NZL3 707 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF175Q9Y473 711 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NPTNQ9Y639 398 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SVILO95425 2214 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MED13LQ71F56 2210 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PCSK5Q92824 1860 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FAM166BA8MTA8 275 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 XRCC2O43543 280 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CDC14BO60729 498 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CA11O75493 328 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PTHLHP12272 177 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FCGR2AP12318 317 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ARR3P36575 388 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PTGFRP43088 359 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PSG4Q00888 419 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 KISS1Q15726 138 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ACTBL2Q562R1 376 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF626Q68DY1 528 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SKA3Q8IX90 412 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ABHD3Q8WU67 409 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 APH1AQ96BI3 265 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RADILQ96JH8 1075 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 S100A13Q99584 98 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PRRT1Q99946 306 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GINS4Q9BRT9 223 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GLRX2Q9NS18 164 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FREM3P0C091 2139 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 LCATP04180 440 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CD3DP04234 171 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CELA3AP09093 270 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 B4GALT1P15291 398 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NAT1P18440 290 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 HTR5AP47898 357 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 VEGFCP49767 419 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TNFSF10P50591 281 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GUCA2AQ02747 115 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SRYQ05066 204 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR10K2Q6IF99 312 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF774Q6NX45 483 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms