RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GRB2P62993 217 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TFDP2Q14188 446 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR1Q1Q15612 314 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KLHL40Q2TBA0 621 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ANKDD1AQ495B1 522 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM228AQ86W67 206 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C3orf22Q8N5N4 141 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DEFB119Q8N690 84 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WDR31Q8NA23 367 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 Q96MT0 163 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIB3Q96RU7 358 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NT5C3AQ9H0P0 336 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HEBP1Q9NRV9 189 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CA10Q9NS85 328 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TREX1Q9NSU2 369 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COX16Q9P0S2 106 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ICOSQ9Y6W8 199 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 JCADQ9P266 1359 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TSPAN11A1L157 253 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C9JQL5 133 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LSM1O15116 133 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FTH1P02794 183 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR2B8PP59922 312 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HSDL1Q3SXM5 330 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR2T5Q6IEZ7 315 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WDR82Q6UXN9 313 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UNC93AQ86WB7 457 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LYPD6Q86Y78 171 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 JAGN1Q8N5M9 183 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR5H2Q8NGV7 314 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR2T29Q8NH02 315 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAB1CQ92928 201 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TPD52L3Q96J77 140 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PPP1R36Q96LQ0 422 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RDH12Q96NR8 316 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DERL3Q96Q80 235 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C20orf24Q9BUV8 137 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UCK2Q9BZX2 261 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRRC19Q9H756 370 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TUBA4BQ9H853 241 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BEX1Q9HBH7 125 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF286AQ9HBT8 521 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ABCB9Q9NP78 766 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DYSFO75923 2080 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GMNCA6NCL1 334 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LEUTXA8MZ59 168 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LY6LH3BQJ8 138 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF13O43567 381 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CTNSO60931 367 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UPK1BO75841 260 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTHLHP12272 177 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MLNP12872 115 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HLA-GP17693 338 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CFHR2P36980 270 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RFC3P40938 356 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF33AQ06730 810 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 INCA1Q0VD86 236 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 STEAP4Q687X5 459 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAB43Q86YS6 212 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC22A9Q8IVM8 553 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ITPRIPQ8IWB1 547 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC30A8Q8IWU4 369 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZDHHC22Q8N966 263 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DNAAF3Q8N9W5 541 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR2M7Q8NG81 312 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR4C5Q8NGB2 326 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR8K1Q8NGG5 319 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR5AR1Q8NGP9 310 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ORAOV1Q8WV07 137 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ASZ1Q8WWH4 475 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SMARCD1Q96GM5 515 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF170Q96K19 258 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NUP58Q9BVL2 599 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ACP6Q9NPH0 428 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EXTL2Q9UBQ6 330 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ENPP4Q9Y6X5 453 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LTBP2Q14767 1821 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ICE1Q9Y2F5 2266 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A0B4J2C4 111 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A1B0GU33 70 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RGS5O15539 181 aa0.53□□□□□ -2.32
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