RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 CEACAM21Q3KPI0 293 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF404Q494X3 552 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM155Q4W5P6 130 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 FAM120AOSQ5T036 256 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZBTB37Q5TC79 503 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 OR2G6Q5TZ20 316 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TEX36Q5VZQ5 186 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TTC23Q5W5X9 447 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 FAM166AQ6J272 317 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 MOB3CQ70IA8 216 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 DOK3Q7L591 496 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 THAP5Q7Z6K1 395 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ANGPTL5Q86XS5 388 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 FAM90A1Q86YD7 464 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 KLBQ86Z14 1044 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 CALHM1Q8IU99 346 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 BATF2Q8N1L9 274 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SPERTQ8NA61 448 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SCCPDHQ8NBX0 429 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF555Q8NEP9 628 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC29Q8WV35 223 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ERGIC1Q969X5 290 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM186Q96B77 213 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TIMD4Q96H15 378 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 RNF170Q96K19 258 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF488Q96MN9 340 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 Q96MT0 163 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 GAL3ST1Q99999 423 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 JAM3Q9BX67 310 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SLC22A4Q9H015 551 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 OPA3Q9H6K4 179 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SP140LQ9H930 580 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 FN3KRPQ9HA64 309 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SMURF1Q9HCE7 757 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 C8orf4Q9NR00 106 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SNTG1Q9NSN8 517 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 FKBP14Q9NWM8 211 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM160Q9NX00 188 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 UBAP1Q9NZ09 502 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ERVK-18Q9QC07 812 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 METRNQ9UJH8 293 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF391Q9UJN7 358 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 KCNS2Q9ULS6 477 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PPIAL4AQ9Y536 164 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 MPC1Q9Y5U8 109 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 LOC105371242A0A075B767 164 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TRAV20A0A0B4J274 112 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PQLC2LA1A4F0 135 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD61A6NGH8 418 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 A6NLC8 198 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM210A6NLX4 147 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SNTNA6NMZ2 147 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 DHRS7CA6NNS2 312 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 H0YJX3 145 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 IFNL4K9M1U5 179 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 OGG1O15527 345 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 SYT7O43581 403 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 FOXH1O75593 365 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZFPL1O95159 310 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ATP6V1G2O95670 118 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 FADS2O95864 444 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 NRASP01111 189 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 IGKV1D-12P01611 117 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 HTR1AP08908 422 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PGA5P0DJD9 388 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PSG2P11465 335 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 PIPP12273 146 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 IRF2P14316 349 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF12P17014 697 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 ATF1P18846 271 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 MYF6P23409 242 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 MPZP25189 248 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 DCKP27707 260 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 GNALP38405 381 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD17-201ENST00000390930 TGM4P49221 684 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms