RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384227.1

RNU6-1201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1201P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SNF8Q96H20 258 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 THTPAQ9BU02 230 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 AP1M1Q9BXS5 423 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 VCX2Q9H322 139 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SYTL2Q9HCH5 934 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 VCX3AQ9NNX9 186 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM9BQ9NQ34 198 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 COMMD8Q9NX08 183 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PISDQ9UG56 409 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR5V1Q9UGF6 321 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMCC3Q9ULS5 477 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ING4Q9UNL4 249 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MEMO1Q9Y316 297 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PLCH2O75038 1416 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CREBBPQ92793 2442 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CUX2O14529 1486 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRAV41A0A0B4J266 112 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM72A0PK05 275 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RFPL4AA6NLU0 287 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C2orf74A8MZ97 194 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FXYD1O00168 92 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 AP3B1O00203 1094 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CDC7O00311 574 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SH2D1AO60880 128 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF737O75373 536 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR7A10O76100 309 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SMC2O95347 1197 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FGGP02679 453 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SERPIND1P05546 499 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CTLA4P16410 223 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TNNI3P19429 210 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BCKDHBP21953 392 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCR1P32246 355 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FOXN2P32314 431 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 P2RY2P41231 377 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SSR1P43307 286 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EVX1P49640 407 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF137PP52743 207 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC18A1P54219 525 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FBXW4P57775 412 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FXYD6P3P58550 94 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KIAA1024LP59773 190 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR7A5Q15622 319 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TEX36Q5VZQ5 186 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NIPAL3Q6P499 406 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC22A9Q8IVM8 553 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 Q8N2B8 174 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FAM133AQ8N9E0 248 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR8A1Q8NGG7 326 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR2A1Q8NGT9 310 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EXOC6Q8TAG9 804 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MBD3L1Q8WWY6 194 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KRT35Q92764 455 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ADTRPQ96IZ2 230 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RNF170Q96K19 258 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KCNS1Q96KK3 526 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IFT74Q96LB3 600 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NSMCE2Q96MF7 247 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ALS2CR12Q96Q35 445 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR5B12Q96R08 314 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EMC6Q9BV81 110 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TAPBPLQ9BX59 468 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PECRQ9BY49 303 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BCL2L14Q9BZR8 327 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRABDQ9H4I3 376 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 VAT1LQ9HCJ6 419 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PXMP2Q9NR77 195 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NRBP2Q9NSY0 501 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPASTQ9UBP0 616 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LHFPL6Q9Y693 200 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ELP1O95163 1332 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SYCE3A1L190 88 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GOSR2O14653 212 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SSX5O60225 188 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RAD1O60671 282 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EEDO75530 441 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms