RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 SDHAF1A6NFY7 115 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA8JA6NMD2 632 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGLL5B9A064 214 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA8NF8WBI6 632 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINC01619G3V211 115 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 H3BQ85 93 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC22O60826 627 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCNB2O95067 398 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 AGTP01019 485 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLTAP09496 248 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA8HP0CJ92 632 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CBR1P16152 277 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 GGT2P36268 569 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RFC3P40938 356 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RGS6P49758 472 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 INCA1Q0VD86 236 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCOTHQ58A44 107 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDZD11Q5EBL8 140 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 BEX5Q5H9J7 111 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC183Q5T5S1 534 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CARD17Q5XLA6 110 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC66Q68CR7 880 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q6ZQT7 251 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 UNC93AQ86WB7 457 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 GABRG1Q8N1C3 465 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2M7Q8NG81 312 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR4D6Q8NGJ1 314 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 MUC7Q8TAX7 377 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASZ1Q8WWH4 475 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 NRGNQ92686 78 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB1CQ92928 201 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RCN3Q96D15 328 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ALS2CR12Q96Q35 445 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHP1Q99653 195 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 AGMATQ9BSE5 352 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIGD2AQ9BW72 106 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACP6Q9NPH0 428 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2S2Q9NQN1 319 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBN2Q6ZU65 1347 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0G2JMP0 313 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0X1KG70 313 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 GGTLC3B5MD39 225 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 C9JQL5 133 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OVOL1O14753 267 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 XRCC2O43543 280 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGKV1-16P04430 117 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR4Q2P0C623 313 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTHLHP12272 177 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IFI30P13284 250 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF708P17019 499 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TEAD1P28347 426 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 HMOX2P30519 316 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LGALS7P47929 136 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 UQCRFS1P47985 274 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUDT2P50583 147 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB9AP51151 201 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 C21orf59P57076 290 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB11AP62491 216 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPS15P62841 145 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 DEFB103AP81534 67 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IL5RAQ01344 420 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 FMODQ06828 376 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CUL2Q13617 745 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPANXN2Q5MJ10 180 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIN9Q5TKA1 542 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB43Q86YS6 212 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDH26Q8IXH8 852 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR56A4Q8NGH8 313 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITFG1Q8TB96 612 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ORAOV1Q8WV07 137 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 YIPF6Q96EC8 236 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OPALINQ96PE5 141 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 UQCC2Q9BRT2 126 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM185BQ9H7F4 350 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 VSIRQ9H7M9 311 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD209Q9NNX6 404 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CA10Q9NS85 328 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMCC3Q9ULS5 477 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 NINLQ9Y2I6 1382 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GU33 70 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PNM2 257 aa0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms