RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEACAM21Q3KPI0 293 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53I3Q53FA7 332 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMRTC1Q5HYR2 192 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTNL3Q6UXE8 466 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZSR3 168 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RORBQ92753 470 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEH1LQ96EE3 360 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TECTBQ96PL2 329 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOXLQ9NUZ1 547 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GW55 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 VENTXO95231 258 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4L3P0CJ86 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4L4P0CJ87 422 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4L7P0CJ90 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG3P63215 75 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTC1P68032 377 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTA1P68133 377 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCXD3Q63HM9 321 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM42Q69YG0 159 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA3Q8NHX4 192 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A7Q99884 636 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR13Q9H1Z4 485 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51I2Q9H344 312 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 KAAG1Q9UBP8 84 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX4Q9UBX2 424 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5B21A6NL26 309 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF732B4DXR9 585 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF91Q05481 1191 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 MICBQ29980 383 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ODF4Q2M2E3 257 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR38Q5JTN6 314 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 STUMQ69YW2 141 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOB3CQ70IA8 216 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOK3Q7L591 496 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG8Q9UK08 70 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0A6YYJ9 748 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS7CA6NNS2 312 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLGAP1O14490 977 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS2O15393 492 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A6O15403 523 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKR7A2O43488 359 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHBDL1O75783 438 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRASP01111 189 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIAL4GP0DN37 164 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMY2BP19961 511 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR3DL2P43630 455 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 GMFBP60983 142 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDONQ4KMG0 1287 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLVS2Q5SYC1 327 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5A2Q8NGI9 324 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 UPRTQ96BW1 309 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS12Q96DT0 336 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL13Q99616 98 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf24Q9BVV8 132 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR173Q9NS66 373 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNTNA6NMZ2 147 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BSH0 61 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DVL1O14640 695 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENSAO43768 121 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPZL2O60487 215 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 HILS1P60008 231 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUSC1Q2TAM9 212 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP43Q70EL4 1123 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGFRL1Q8N441 504 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPIFB2Q8N4F0 458 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM216BQ8N7L0 139 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 APH1BQ8WW43 257 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C22orf15Q8WYQ4 148 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP3Q92482 292 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RDH12Q96NR8 316 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP50Q9UKX7 468 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GVI7 797 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAPL1A0PJW8 107 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms