RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 RAMP1O60894 148 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 S100A6P06703 90 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 NAT2P11245 290 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 DRD1P21728 446 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 IGSF11Q5DX21 431 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 SCRT1Q9BWW7 348 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 PECRQ9BY49 303 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 MYO7BQ6PIF6 2116 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 MSTNO14793 375 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 TAAR5O14804 337 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 IFNA2P01563 188 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 RNF4P78317 190 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 ARG1P05089 322 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 FOLR1P15328 257 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 ACKR3P25106 362 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 CLRN1P58418 232 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 OR6S1Q8NH40 331 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 SCGB3A2Q96PL1 93 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 RAB33BQ9H082 229 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GV50 99 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PNR3 127 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 FOSL2P15408 326 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 AGAP20933 346 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 MYBPHQ13203 477 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 C6orf201Q7Z4U5 140 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 PRRX2Q99811 253 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 LIME1Q9H400 295 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 WFDC1Q9HC57 220 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PPC4 97 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 STMND1H3BQB6 276 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 MASP2O00187 686 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 DEDDO75618 318 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 KISS1Q15726 138 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 SP6Q3SY56 376 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 FAM89BQ8N5H3 189 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 SHDQ96IW2 340 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 LYZL4Q96KX0 146 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 SPACA1Q9HBV2 294 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 GHRLQ9UBU3 117 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 LILRA5A6NI73 299 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 M0R036 132 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 GLI4P10075 376 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 RBMXP38159 391 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 GABREP78334 506 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 ZNF283Q8N7M2 679 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 LYPD6BQ8NI32 183 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 CLEC1BQ9P126 229 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP3-201ENST00000321337 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 SMIM6P0DI80 62 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 PGA4P0DJD7 388 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 PGA3P0DJD8 388 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 MYF5P13349 255 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 CCR5P51681 352 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 OR1D5P58170 312 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 ZNF616Q08AN1 781 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 ST8SIA1Q92185 356 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 DDIT4LQ96D03 193 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 STARD10Q9Y365 291 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 TXNL1O43396 289 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 TSPAN15O95858 294 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 CFHR1Q03591 330 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 OR14K1Q8NGZ2 314 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 FNDC9Q8TBE3 224 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 MEMO1Q9Y316 297 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 KPTNQ9Y664 436 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 NQO2P16083 231 aa22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 SNCAP37840 140 aa22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 TAS2R46P59540 309 aa22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 OR2B8PP59922 312 aa22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 FAM24BQ8N5W8 94 aa22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 ZNF251Q9BRH9 671 aa22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SENP3-201ENST00000321337 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms