RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219476.7

TSC2-201, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene TSC2, Length 6,156 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-201ENST00000219476 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.92□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ROM1Q03395 351 aa14.92□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 PDPNQ86YL7 162 aa14.92□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ASB16Q96NS5 453 aa14.92□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 GPR3P46089 330 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 VRK3Q8IV63 474 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 GHITMQ9H3K2 345 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 C3orf80F5H4A9 247 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 MGMTP16455 207 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 PI3P19957 117 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 PPP6CO00743 305 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 SLC2A10O95528 541 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 CD82P27701 267 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 PSMB6P28072 239 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 TEAD3Q99594 435 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 LALBAP00709 142 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 CA6P23280 308 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 AQP6Q13520 282 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ECSCRQ19T08 205 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 OR2T2Q6IF00 324 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 PATE1Q8WXA2 126 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 PHLPP1O60346 1717 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 A0A1W2PPC4 97 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 H3BP45 60 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.91□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 FZD6O60353 706 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 MELTFP08582 738 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 DDOSTP39656 456 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ZNF519Q8TB69 540 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 GABRA1P14867 456 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ZXDAP98168 799 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 LPAR6P43657 344 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 Q8WTZ3 238 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 DERL3Q96Q80 235 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 GPANK1O95872 356 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 CD37P11049 281 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ST6GAL1P15907 406 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 FPR2P25090 351 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 LOXL3P58215 753 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 RELAQ04206 551 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 LMO3Q8TAP4 145 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 NUDT8Q8WV74 236 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 ALG1L2C9J202 215 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 NUDT3O95989 172 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 CDAP32320 146 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 OR52I2Q8NH67 350 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.9□□□□□ -0.02
TSC2-201ENST00000219476 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 FGF17O60258 216 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 RELBQ01201 579 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 MYF5P13349 255 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 VDAC1P21796 283 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.89□□□□□ -0.03
TSC2-201ENST00000219476 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms