RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 TMEM42Q69YG0 159 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 STUMQ69YW2 141 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OR2T27Q8NH04 317 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 LRRC29Q8WV35 223 aa7.53□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 C10orf35Q96D05 121 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TECTBQ96PL2 329 aa7.53□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.52□□□□□ -1.21
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PKP4-218ENST00000629219 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 OR51I2Q9H344 312 aa7.52□□□□□ -1.21
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PKP4-218ENST00000629219 BRD7Q9NPI1 651 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 RASL12Q9NYN1 266 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-218ENST00000629219 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.52□□□□□ -1.21
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