RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 AKR1C2P52895 323 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 AKR1C1Q04828 323 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 SGCAQ16586 387 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 DRAM2Q6UX65 266 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM123Q8N131 208 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM100Q9NV29 134 aa11.71□□□□□ -0.53
C9orf170-201ENST00000623052 UMODP07911 640 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 GLRA1P23415 457 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PTGFRP43088 359 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 IL15RAQ13261 267 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SAP25Q8TEE9 199 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 NTNG2Q96CW9 530 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 GPER1Q99527 375 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PECRQ9BY49 303 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 OR10A2Q9H208 303 aa11.71□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0B4J2A0 478 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 CCL3P10147 92 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ALDH3B1P43353 468 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H3AP68431 136 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 C10orf128Q5T292 105 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF726A6NNF4 738 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 G3V3Y1 287 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 STMND1H3BQB6 276 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 FAM157CP0CG43 387 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 CD79AP11912 226 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ADH6P28332 368 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 DEFA5Q01523 94 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 MST1LQ2TV78 715 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ACTBL2Q562R1 376 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZSR3 168 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC18Q8N456 261 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 WNT2BQ93097 391 aa11.7□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 F5H5K5 113 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 AMY2BP19961 511 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINA2P20848 420 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 MSR1P21757 451 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35A1P78382 337 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 HGFACQ04756 655 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ECH1Q13011 328 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 POC1AQ8NBT0 407 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PGAM5Q96HS1 289 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 GNRHR2Q96P88 292 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 RAB18Q9NP72 206 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 GPR31O00270 319 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 WDPCPO95876 746 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM17Q86X19 198 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 NELFAQ9H3P2 528 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PIGMQ9H3S5 423 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 LHX6Q9UPM6 363 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ABCD4O14678 606 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ZIC3O60481 467 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 DHRS3O75911 302 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PTGER4P35408 488 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 TMED6Q8WW62 240 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PIGTQ969N2 578 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 MARC2Q969Z3 335 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 CLDN23Q96B33 292 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 FBXO17Q96EF6 278 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 TM2D1Q9BX74 207 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 CHST5Q9GZS9 411 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0U1RQV5 110 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PLATP00750 562 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.9 ms