RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MRGPRGQ86SM5 289 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF101Q8IZC7 436 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ITPKCQ96DU7 683 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 WBP1Q96G27 269 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SPACA5Q96QH8 159 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ATG5Q9H1Y0 275 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 TINAGQ9UJW2 476 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 IL32P24001 234 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ZP1P60852 638 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 DGCR2P98153 550 aa19.63■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 TUBG2Q9NRH3 451 aa19.63■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 FAM189A2Q15884 450 aa19.62■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 OR10K2Q6IF99 312 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ASCL4Q6XD76 172 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CDH24Q86UP0 819 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF21AQ96BD5 680 aa19.62■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 SLC22A4Q9H015 551 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 FAIMQ9NVQ4 179 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ELOVL5Q9NYP7 299 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC7A11Q9UPY5 501 aa19.62■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 NCOR2Q9Y618 2525 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CD300LBA8K4G0 201 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM4BO94953 1096 aa19.61■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 MOB3CQ70IA8 216 aa19.61■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf174Q8IYL3 243 aa19.6■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 STEAP2Q8NFT2 490 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa19.6■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV18A0A075B6X5 111 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF850A8MQ14 1090 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB27BO00194 218 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SULT1C2O00338 296 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC14BO60729 498 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CD3GP09693 182 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CECR9P0C854 216 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP1B3P54709 279 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 UCP2P55851 309 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCXD3Q63HM9 321 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa19.59■□□□□ 0.73
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CAPNS1-207ENST00000589146 OR52I2Q8NH67 350 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 S100PBPQ96BU1 408 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10A4Q9H209 315 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 LYRM1O43325 122 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ORC5O43913 435 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 RAC2P15153 192 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 BMP5P22003 454 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDX4Q13162 271 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 DYRK1AQ13627 763 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 C1QL2Q7Z5L3 287 aa19.58■□□□□ 0.72
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