RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 DHDHQ9UQ10 334 aa11.78□□□□□ -0.52
TRAF4-215ENST00000584944 JMJD1CQ15652 2540 aa11.78□□□□□ -0.52
TRAF4-215ENST00000584944 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 USF3Q68DE3 2245 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CLDN25C9JDP6 229 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 H0YL77 283 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 IFNL4K9M1U5 179 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 NDUFS8O00217 210 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 LILRA1O75019 489 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CST4P01036 141 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ISG15P05161 165 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 GRPP07492 148 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CD55P08174 381 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 KIR3DL2P43630 455 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CLEC9AQ6UXN8 241 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MOB3CQ70IA8 216 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 C1orf87Q8N0U7 546 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ITLN1Q8WWA0 313 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 RAB1CQ92928 201 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 RNF170Q96K19 258 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 DUSP21Q9H596 190 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CHODLQ9H9P2 273 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ISPDA4D126 451 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 E9PI62 339 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 NCR1O76036 304 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ZFPL1O95159 310 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MT-ND2P03891 347 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 HEXAP06865 529 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CELP19835 753 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ANOS1P23352 680 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ACKR3P25106 362 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CRYBB2P43320 205 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CDK5R1Q15078 307 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CEP78Q5JTW2 689 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 RNLSQ5VYX0 342 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 GPR148Q8TDV2 347 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 PP6455Q8WZ26 134 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 C10orf35Q96D05 121 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 SMIM19Q96E16 107 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 TECTBQ96PL2 329 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 TREM2Q9NZC2 230 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CKLFQ9UBR5 152 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 V9GYS6 101 aa11.76□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GTI1 187 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 A6NIN4 97 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MAGEB3O15480 346 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MLNRO43193 412 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 TNFAIP8O95379 198 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 LY6G6DO95868 133 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 LYNX1P0DP58 116 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 SLC25A16P16260 332 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CCL1P22362 96 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 GPM6AP51674 278 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM33P57088 247 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 BDH1Q02338 343 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 THRSPQ92748 146 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 GHSRQ92847 366 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 UFD1Q92890 307 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ERGIC1Q969X5 290 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 FGGYQ96C11 551 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF649Q9BS31 505 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 ZANQ9Y493 2812 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 OR5B21A6NL26 309 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM210A6NLX4 147 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 COL8A2P25067 703 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CD200P41217 278 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 SOX2P48431 317 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CHN2P52757 468 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 PPP3R1P63098 170 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 GNG3P63215 75 aa11.74□□□□□ -0.53
TRAF4-215ENST00000584944 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms