RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 SERPINA5P05154 406 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CD300CQ08708 224 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDNEP1-210ENST00000574322 TATDN3Q17R31 274 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MOGAT2Q3SYC2 334 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF101Q8IZC7 436 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCNOP22674 350 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 VEGFCP49767 419 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 VWA1Q6PCB0 445 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASCL4Q6XD76 172 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEM1Q6ZVN7 128 aa24.57■■□□□ 1.52
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