RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q8NA96 180 aa25.19■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM122AQ96E09 287 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 COPZ2Q9P299 210 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB27BO00194 218 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 BEND4Q6ZU67 534 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDH24Q86UP0 819 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACBD4Q8NC06 268 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBASH3BQ8TF42 649 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHAC2Q8WUX2 184 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CREB3L1Q96BA8 519 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 MS4A3Q96HJ5 214 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 MARVELD1Q9BSK0 173 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPAP1Q9NZP6 1156 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC7A11Q9UPY5 501 aa25.18■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TDGF1P3P51864 188 aa25.17■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CXADRP78310 365 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 P2RY6Q15077 328 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf91Q3C1V1 193 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 MOGAT2Q3SYC2 334 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 DMRTC1Q5HYR2 192 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 C17orf78Q8N4C9 275 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 BORCS8Q96FH0 119 aa25.17■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM59Q9BXS4 323 aa25.17■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 STARD10Q9Y365 291 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 FUT6P51993 359 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGAP6Q5VW22 663 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF610Q8N9Z0 462 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPX8Q8TED1 209 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGCQ92535 297 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 HRASLSQ9HDD0 168 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 FRYQ5TBA9 3013 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPIG6BO95866 241 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSF1P09603 554 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS12P56730 875 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLCCI1Q86VQ1 547 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 LPAR5Q9H1C0 372 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTTG3PQ9NZH4 202 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 NGFP01138 241 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 LPLP06858 475 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 WNT5AP41221 380 aa25.15■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OLFML2AQ68BL7 652 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 MOB3CQ70IA8 216 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 FTMTQ8N4E7 242 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5D18Q8NGL1 313 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR10R2Q8NGX6 335 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 TUBD1Q9UJT1 453 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCHS1Q96JQ0 3298 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa25.15■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP1B3P54709 279 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACTBP60709 375 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZP1P60852 638 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACTG1P63261 375 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF260Q3ZCT1 412 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC22A6Q4U2R8 563 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLCXD3Q63HM9 321 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM104Q8NE00 496 aa25.15■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa25.15■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MT-ND4P03905 459 aa25.14■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PCGF3Q3KNV8 242 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHST4Q8NCG5 386 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 STEAP2Q8NFT2 490 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEH1LQ96EE3 360 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDH20Q9HBT6 801 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRRG2O14669 202 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 ICMTO60725 284 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 GIFP27352 417 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAUP35544 74 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTG1P62324 171 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1QL2Q7Z5L3 287 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR56B1Q8NGI3 324 aa25.13■■□□□ 1.61
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