RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ESM1Q9NQ30 184 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPR84Q9NQS5 396 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1B0GW55 424 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM77I1YAP6 450 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMPRSS2O15393 492 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF254O75437 659 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACTR3P61158 418 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 FGF12P61328 243 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP43Q70EL4 1123 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 FGFRL1Q8N441 504 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX5Q96PT3 197 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 JMJD8Q96S16 334 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCL13Q99616 98 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLN6Q9NWW5 311 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUX4Q9UBX2 424 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 H3BNX3 289 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 DVL1O14640 695 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP2K3P46734 347 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPM6AP51674 278 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 MICBQ29980 383 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR38Q5JTN6 314 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 MOB3CQ70IA8 216 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSX6Q7RTT6 188 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ST8SIA4Q92187 359 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A0U1RQV5 110 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACOD1A6NK06 481 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 EI24O14681 340 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 AKR7A2O43488 359 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 NDUFA2O43678 99 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 FCN3O75636 299 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TFF1P04155 84 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAHP16930 419 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 HTR1FP30939 366 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCTDP32321 178 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP6V1E1P36543 226 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPY4RP50391 375 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 IKZF1Q13422 519 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBE2FQ969M7 185 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 UPRTQ96BW1 309 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCB9Q9NP78 766 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 R4GMQ9 66 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATRQ13535 2644 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM210A6NLX4 147 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF732B4DXR9 585 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 H3BSH0 61 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 HAX1O00165 279 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTRP02766 147 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 SFTPBP07988 381 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 EGR3Q06889 387 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ODF4Q2M2E3 257 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms