RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 PSG7Q13046 419 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRDX4Q13162 271 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 INSL4Q14641 139 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR8G1Q15617 311 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ADIPOQQ15848 244 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 CEP78Q5JTW2 689 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 DDI2Q5TDH0 399 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 AGAP6Q5VW22 663 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 MUC15Q8N387 334 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR8G5Q8NG78 346 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR13G1Q8NGZ3 307 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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CTDNEP1-204ENST00000570484 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 PIGCQ92535 297 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 SPSB1Q96BD6 273 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 HAVCR1Q96D42 359 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 BORCS8Q96FH0 119 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 GPER1Q99527 375 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 MICU1Q9BPX6 476 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 GPR173Q9NS66 373 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TAAR3PQ9P1P4 343 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 SVILO95425 2214 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 DPPA5A6NC42 116 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 A6NIN4 97 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR5B21A6NL26 309 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 A6NLC8 198 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 B9A039 149 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 H3BMQ9 156 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 LMX1BO60663 402 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 SC5DO75845 299 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 CYB5AP00167 134 aa5.63□□□□□ -1.51
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CTDNEP1-204ENST00000570484 CST4P01036 141 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 IGHV3-13P01766 116 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAB3BP20337 219 aa5.63□□□□□ -1.51
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CTDNEP1-204ENST00000570484 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 BDKRB2P30411 391 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 CRYBB2P43320 205 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ALDH3B1P43353 468 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF81P51508 661 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 NCS1P62166 190 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TLE4Q04727 773 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 MXD1Q05195 221 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.63□□□□□ -1.51
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CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 MOB3CQ70IA8 216 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 UTS2BQ765I0 119 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TPRA1Q86W33 373 aa5.63□□□□□ -1.51
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CTDNEP1-204ENST00000570484 NEUROG1Q92886 237 aa5.63□□□□□ -1.51
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 DIRC2Q96SL1 478 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 S100A13Q99584 98 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.63□□□□□ -1.51
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CTDNEP1-204ENST00000570484 CENPOQ9BU64 300 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMEM100Q9NV29 134 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 MED12LQ86YW9 2145 aa5.63□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CTDNEP1-204ENST00000570484 POLEQ07864 2286 aa5.62□□□□□ -1.51
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