RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H3A	P68431	136 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZSR3	168 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TM2D1	Q9BX74	207 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	FAM117A	Q9C073	453 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CHST5	Q9GZS9	411 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT19	A8MXV4	375 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559		F5H5K5	113 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	FGF16	O43320	207 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	KLK2	P20151	261 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CPT2	P23786	658 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MC2R	Q01718	297 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	BAP18	Q8IXM2	172 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	HAS2	Q92819	552 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	LYZL4	Q96KX0	146 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RNF126	Q9BV68	326 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		16.18	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	LYL1	P12980	280 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ANOS1	P23352	680 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ECI1	P42126	302 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC157	Q569K6	752 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SPTSSA	Q969W0	71 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC46	Q96FV0	321 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		16.17	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	STMND1	H3BQB6	276 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	DHH	O43323	396 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CTRB1	P17538	263 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PI4KA	P42356	2102 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RNF141	Q8WVD5	230 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PECR	Q9BY49	303 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	EHF	Q9NZC4	300 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MPTX1	A8MV57	137 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559		E9PLN8	166 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	FCGR2A	P12318	317 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	LIF	P15018	202 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF84	P51523	738 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	DEFA5	Q01523	94 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RAET1L	Q5VY80	246 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	M1AP	Q8TC57	530 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	NABP1	Q96AH0	204 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf50	Q96LR7	162 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM100	Q9NV29	134 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MEMO1	Q9Y316	297 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SPEG	Q15772	3267 aa		16.16	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559		M0R135	149 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2V2	Q15819	145 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM123	Q8N131	208 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF799	Q96GE5	643 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	DKKL1	Q9UK85	242 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MED12	Q93074	2177 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TOR1A	O14656	332 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	HPN	P05981	417 aa		16.15	■□□□□ 0.18
RRN3-205	ENST00000563559	FAH	P16930	419 aa		16.15	■□□□□ 0.18

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