RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSG4Q00888 419 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 MADCAM1Q13477 382 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 LY6DQ14210 128 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB35Q15286 201 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSC22D1Q15714 1073 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF404Q494X3 552 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q499Y3 187 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 YIF1BQ5BJH7 314 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM27BQ5VT28 67 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTL6Q6ICC9 239 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR2A2Q6IF42 318 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM65Q6PI78 240 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 DEGS2Q6QHC5 323 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 NAA40Q86UY6 237 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR8B12Q8NGG6 310 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR51A4Q8NGJ6 313 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR1K1Q8NGR3 316 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR1F12Q8NHA8 337 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPS4Y2Q8TD47 263 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR148Q8TDV2 347 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPTSSAQ969W0 71 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 PGAM5Q96HS1 289 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 LYZL4Q96KX0 146 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 DERL3Q96Q80 235 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 COQ7Q99807 217 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 BARHL1Q9BZE3 327 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR2H1Q9GZK4 316 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 WNT5BQ9H1J7 359 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOX3Q9HBY0 568 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLRX2Q9NS18 164 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM206AQ9NX38 181 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 TINAGQ9UJW2 476 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 PROCRQ9UNN8 238 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHDHQ9UQ10 334 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPTBN2O15020 2390 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1B0GVI7 797 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 C5orf63A6NC05 138 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 A6NIN4 97 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 M0R135 149 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIN1P1O15428 100 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 RGS5O15539 181 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYT7O43581 403 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYNGR3O43761 229 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC19A2O60779 497 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SC5DO75845 299 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL6IP5O75915 188 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTRP02766 147 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 LCATP04180 440 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAS1P04201 325 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 UCHL1P09936 223 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACSM4P0C7M7 580 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 PF4V1P10720 104 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSG1P11464 419 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCL2P13500 99 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB3BP20337 219 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACHEP22303 614 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 GALP22466 123 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV1-2P23083 117 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 S100A5P33763 92 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 GNALP38405 381 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCR9P51686 369 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIST1H3AP68431 136 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLRB1Q12918 225 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms