RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556082.5

ATXN3-235, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-235ENST00000556082 NUDT15Q9NV35 164 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 NCKAP5O14513 1909 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SPEGQ15772 3267 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 A0A0A6YYJ9 748 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 XRCC2O43543 280 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GMDSO60547 372 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PEX14O75381 377 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 NDUFB6O95139 128 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TGM6O95932 706 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MT-ND4P03905 459 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 LCATP04180 440 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CD74P04233 296 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 IL5P05113 134 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SERPINA5P05154 406 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 HCKP08631 526 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 AKAIN1P0CW23 69 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 RAC2P15153 192 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF24P17028 368 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MPZP25189 248 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MPGP29372 298 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PTGFRP43088 359 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 OR3A2P47893 321 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 HTR5AP47898 357 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CCR6P51684 374 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TAS2R19P59542 299 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 KISS1Q15726 138 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 UBE2V2Q15819 145 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GSG1Q2KHT4 349 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CD276Q5ZPR3 534 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 AWAT2Q6E213 333 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MTFR2Q6P444 385 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ASCL4Q6XD76 172 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 REEP6Q96HR9 211 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 BOD1Q96IK1 185 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MCUBQ9NWR8 336 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 UPB1Q9UBR1 384 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MED13Q9UHV7 2174 aa7.2□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 A0A1B0GUH1 482 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 WIPF3A6NGB9 483 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 AHRRA9YTQ3 701 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 H3BS24 57 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CDC14BO60729 498 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CA11O75493 328 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PTHLHP12272 177 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 FAHP16930 419 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TBPP20226 339 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 AGTR1P30556 359 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 RCVRNP35243 200 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 FAM3AP98173 230 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 HGFACQ04756 655 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ARL6IP1Q15041 203 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PPA1Q15181 289 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GUSBP1Q15486 140 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 OR8B8Q15620 311 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CDNFQ49AH0 187 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 OR10K2Q6IF99 312 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PIGTQ969N2 578 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SARAFQ96BY9 339 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TM2D1Q9BX74 207 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CST11Q9H112 138 aa7.19□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms