RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CYR61O00622 381 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRB-209ENST00000550857 SSX4O60224 188 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-209ENST00000550857 AADACP22760 399 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-209ENST00000550857 SCAND1P57086 179 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-209ENST00000550857 NRN1LQ496H8 165 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-209ENST00000550857 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-209ENST00000550857 Q56UQ5 140 aa7.14□□□□□ -1.27
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